Fue diputado uninominal suplente del MAS en la circunscripción 4 de Chuquisaca, y antes de su designación ministerial era miembro de comisiones como Salud, Deportes y Recreación. Red Uno
También ocupó el cargo de Secretario Departamental de Medio Ambiente, Madre Tierra y Agua en el Gobierno Autónomo Departamental de Chuquisaca. Red Uno
En agosto de 2024 fue posesionado como Ministro de Desarrollo Rural y Tierras, en sustitución de Santos Condori Nina. eldiario.net
Acusaciones graves / denuncias
En diciembre de 2024 una funcionaria interpuso una denuncia penal contra Flores, acusándolo de agresión sexual. Según la denuncia, el 11 de octubre de 2024, en su oficina, Flores primero habría besado a la funcionaria en los labios y luego en un dormitorio o sala de descanso con sofá cama la habría agredido sexualmente. Noticias Fides